Герой Лего Ніндзя Го виконує місію в банді. Він нещодавно вийшов з академії і став працювати на одну з великих корпорацій. Ця структура прагне поширити свій вплив на весь світ і від цього постійно конфліктує з конкурентами, які бажають досягти того ж. Хлопець тільки вступив в цю діяльність, але був викрадений ворогами. Він опинився на чужій базі і почав планомірно її досліджувати. У пошуках виходу він повинен оберігатися роботів-охоронців і потужних бійців. Проти них він застосовує гострі зірочки. Артефакти суші відновлюють підірване в боях здоров'я. А збір пачок грошей особливо образить мафіозному босові. У грі треба активно використовувати вміння ніндзя ковзати по стінах.
.